[党政管理机构]
 
  学校办公室    党委组织部    组织员办公室
  党委宣传部(新闻中心)、党委教师工作部    党委统战部   
  纪检监察办公室      学生工作部(处)、武装部
  保卫部(处)、社会治安综合治理办公室    离退休工作处
  发展规划与政策法规处    教务处      科技管理处
  人事处(劳动用工管理服务中心)人才工作办公室    计划财务处
  国有资产管理处    招生就业工作处
  国际合作与交流处(港澳台事务办公室)  后勤保障处    基建处
  审计处   校友工作办公室(校庆筹备工作办公室 
[群团组织]
 
  团委    工会(妇委会)    关心下一代工作委员会              
[教学机构]
 
  研究生院(研究生工作部、学科建设工作办公室)   农学院
  动物科学技术学院     资源与环境学院     经济管理学院
  食品科学与工程学院     中药材学院     园艺学院
  生命科学学院    工程技术学院   信息技术学院     马克思主义学院
  人文学院  外国语学院   国际教育交流学院   军事体育教研部
  继续教育学院、 全国重点建设职业教育师资培养培训基地办公室
[教学科研辅助机构]
 
  党委党校干部培训中心  高等教育研究所   教师教学发展中心
  图书馆       档案馆      科技出版部  教研基地管理处
  校医院      赞比亚农业技术示范中心       大学生心理咨询中心
  信息化中心     采购与招投标管理中心     科技推广中心
 
 
[科研机构]
 
  小麦和玉米深加工国家工程实验室  人参新品种选育与开发国家地方联合工程研究中心
  生态恢复与生态系统管理省部共建国家重点实验室培育基地 
  农业部参茸产品质量监督检验测试中心   吉林省大豆区域技术创新中心  
  农业部北方食用菌资源利用重点实验室   农业部参茸产品质量安全风险评估实验室  
  国家农作物品种审定特性鉴定站   食用菌加工技术集成科研基地  
  动物生产及产品质量安全教育部重点实验室  生物反应器与药物开发教育部工程研究中心
  食药用菌教育部工程研究中心   现代农业技术国际合作联合实验室  
  药用植物栽培与育种实验室   吉林省动物营养与饲料科学重点实验室  
  吉林省商品粮基地土壤资源可持续利用重点实验室  
  吉林省分析测试联合中心长春农业分中心 
  农业现代化综合技术研究所  吉林省人参工程技术研究中心  吉林省食用菌科技创新中心
  吉林省食品生物制造科技创新中心  
  吉林省主要农作物常规与生物技术育种研发公共服务平台  
  食品生物制造国际科技合作基地   吉林省小浆果研究与示范国际科技合作基地  
  吉林省菌物资源国家联合研究中心   吉林省农业物联网科技协同创新中心  
  吉林省生物防治工程技术研究中心   吉林省食品工程及食品安全工程研究中心  
  吉林省菌类作物工程实验室   吉林省动物微生态制剂工程研究中心  
  吉林省人参规范化生产技术工程研究中心  吉林省人参基因资源开发与利用工程研究中心
  吉林省小浆果遗传育种与创新利用工程研究中心   吉林省智能环境工程研究中心  
  吉林省藜麦工程研究中心   吉林省反刍动物繁育生物技术与健康养殖工程实验室
  经济菌物吉林省高校高端科技创新平台   秸秆综合利用吉林省高校高端科技创新平台
  国家商品粮基地可持续发展重大需求协同创新中心   经济菌物协同创新中心
  吉林省生物医药技术工程研究中心   生物反应器及药物开发重点实验室  
  农产品深加工联合实验室   粮食主产区农村经济研究中心  
  食药用菌产业化工程研究中心   天敌昆虫应用技术工程研究中心  
  作物分子育种重点实验室   吉林省新兽药研发与创制重点实验室  
  吉林省家政服务业研究中心   吉林省德育与学生发展研究中心  
  粮食精深加工与副产物高效利用技术创新重点实验室  
  吉林省信息技术与智能农业工程研究中心   药用菌物资源及其开发利用研究室  
  长白山中药药效物质研究室   药用动物实验室   梅花鹿生产技术研究室  
  吉林省农村经济研究基地   吉林省高校德育研究基地  
  吉林省东北农业生物国际科技孵化基地   吉林省食用菌公共服务平台  
  吉林省参茸产品质量监督检验站   吉林省高校教师培养与创新服务中心  
  吉林省物联网工程技术研究中心   吉林省生物信息学研究中心  
  吉林省蓝莓研究中心   新能源科学与工程试验研究中心