2009年，我校荣获吉林省科学技术进步奖14项，其中，一等奖4项，二等奖4项，三等奖6项。我校连续七年获吉林省科技进步奖数量居全省高校第二位。

由张艳荣教授主持的《ω-6多不饱和脂肪酸的提取及玉米ω-6软胶囊的研制》、秦贵信教授主持的《大豆主要抗营养因子的抗营养机制及钝化机理的研究》、姜云垒教授联合申报的《蝙蝠回声定位行为生态与系统进化研究》、张连学教授联合申报的《人参、西洋参标准化及系列产品开发研究》等4项科技成果荣获2009年吉林省科学技术进步一等奖。

由杨伟光教授主持的《高产、优质、多抗玉米新品种吉玉106选育与推广》、王丕武教授主持的《高产、优质、抗病大豆新品种吉农17号、吉农18号选育与示范推广》、胡耀辉教授主持的《玉米淀粉发酵法生产赤藓糖醇的研究》、祁新副教授联合申报的《优质、高产、多抗、广适、耐密玉米新品种“益丰29号”选育与推广》等4项科技成果荣获2009年吉林省科学技术进步二等奖。

由任跃英教授主持的《中药材桔梗的生产技术规程及质量控制体系》、吕文发副教授主持的《奶牛高效繁殖综合技术》、赵权教授主持的《不同地理株柔嫩艾美耳球虫弱毒苗研究》、钱爱东教授主持的《牛主要病毒病核酸探针和多重PCR系列诊断的研究》、窦森教授主持的《吉林省耕地质量与补充耕地数量质量实行按等级折算技术研究》、胡桂学教授联合申报的《鸭病毒性肝炎病原特性及综合防治技术研究》等6项科技成果荣获2009年吉林省科学技术进步三等奖。